سیستم فیلتراسیون دستگاه های صنعتی مکنده باید متناسب با صنعت انتخاب شود. همیشه یکی از چالش های که برای خریداران این دستگاه وجود دارد انتخاب سیستم فیلتراسیون است. در برخی صنایع نیاز است که حتی یک ذره با حجم میکرونی هم روی زمین باقی نماند. مثلا در صنایع غذایی ذرات بسیار کوچکی مانند ذرات قهوه یا ذرات فلفل قرمز روی زمین یا معلق در هوای باشند باعث حساسیت کارکنان می شوند. وجود گرد و غبار و ذرات معلق در هوا تهدیدی برای سلامت پرسنل است.

در شرایط این چنینی فیلتر انتخابی باید قادر باشد حداقل 99.97 درصد ذرات با قطر حداقل سه دهم میکرومتر را جمع آوری کند. از بین فیلترها نمونه HEPA قادر به حذف ذرات با قطر بسیار کم است.

پس در هر صنعتی که فعالیت کنید یک سری دستورالعمل های بهداشتی و ایمنی بایستی رعایت شود. انتخاب تجهیزات نظافتی هم باید بر اساس استانداردهای تعیین شده توسط صنعت مورد نظر باشد. بر اساس این دستورالعمل ها باید آلاینده ها جمع آوری شوند و نظافت صحیح حاصل شود.